8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36027
Cell Name :  110418-MV-13C
Archive Name :  Margrie
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.2 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  21 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  corticothalamic, Regular spiking
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-16
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  110418-MV-13C.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The stimulus selectivity and connectivity of layer six principal cells reveals cortical microcircuits underlying visual processing.

Measurements
Soma Surface :  283.39 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  96
Number of Branches :  199
Overall Width :  1210.09 μm
Overall Height :  828.59 μm
Overall Depth :  249.82 μm
Average Diameter :  0.6 μm
Total Length :  7505.4 μm
Total Surface :  14056.3 μm2
Total Volume :  4898.14 μm3
Max Euclidean Distance :  1253.74 μm
Max Path Distance :  1412.56 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  2887
Partition Asymmetry :  0.68
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  83.56°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.61°
Fractal Dimension :  1.04

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