8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_151975
Cell Name :  10_REDO-844-GM18-Ctl-Ctl-Chow-BNL16A-CA1Finished2a
Archive Name :  Acharya
Species Name :  mouse
Strain :  Tg(Thy1-EGFP)MJrs
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  9.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-12-16
Date of Upload :  2021-05-24
Persistence Vector :  10_REDO-844-GM18-Ctl-Ctl-Chow-BNL16A-CA1Finished2a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Mitigation of helium irradiation-induced brain injury by microglia depletion.

Measurements
Soma Surface :  53.4 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  404
Number of Branches :  812
Overall Width :  84.29 μm
Overall Height :  147.11 μm
Overall Depth :  32.43 μm
Average Diameter :  0.7 μm
Total Length :  2390.38 μm
Total Surface :  5173.15 μm2
Total Volume :  937.62 μm3
Max Euclidean Distance :  177.9 μm
Max Path Distance :  191.22 μm
Max Branch Order :  110
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  5598
Partition Asymmetry :  0.78
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  26.81°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.75°
Fractal Dimension :  1.03

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