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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_151950
Cell Name :  10_881-GM18-Ctl-Ctl-Chow-BNL16A-CA1Finished2b
Archive Name :  Acharya
Species Name :  mouse
Strain :  Tg(Thy1-EGFP)MJrs
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  9.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-12-16
Date of Upload :  2021-05-24
Persistence Vector :  10_881-GM18-Ctl-Ctl-Chow-BNL16A-CA1Finished2b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Mitigation of helium irradiation-induced brain injury by microglia depletion.

Measurements
Soma Surface :  79.61 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  274
Number of Branches :  553
Overall Width :  69.96 μm
Overall Height :  279.65 μm
Overall Depth :  86.6 μm
Average Diameter :  0.74 μm
Total Length :  1811.83 μm
Total Surface :  4125.39 μm2
Total Volume :  794.92 μm3
Max Euclidean Distance :  261.62 μm
Max Path Distance :  278.59 μm
Max Branch Order :  95
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  2575
Partition Asymmetry :  0.83
Average Rall's Ratio :  1.92
Average Bifurcation Angle Local :  31.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.3°
Fractal Dimension :  1.02

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