8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_151967
Cell Name :  10_829-GM18-Ctl-Ctl-Chow-BNL16A-CA1Finished2c
Archive Name :  Acharya
Species Name :  mouse
Strain :  Tg(Thy1-EGFP)MJrs
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  9.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-12-16
Date of Upload :  2021-05-24
Persistence Vector :  10_829-GM18-Ctl-Ctl-Chow-BNL16A-CA1Finished2c.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Mitigation of helium irradiation-induced brain injury by microglia depletion.

Measurements
Soma Surface :  590.18 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  2050
Number of Branches :  4104
Overall Width :  105.95 μm
Overall Height :  325.84 μm
Overall Depth :  71.32 μm
Average Diameter :  1.26 μm
Total Length :  9166.48 μm
Total Surface :  32490.4 μm2
Total Volume :  11398 μm3
Max Euclidean Distance :  335.51 μm
Max Path Distance :  381.75 μm
Max Branch Order :  160
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  6759
Partition Asymmetry :  0.82
Average Rall's Ratio :  1.71
Average Bifurcation Angle Local :  41.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.65°
Fractal Dimension :  1.22

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