8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_167877
Cell Name :  1-3-6-Neuron-Final
Archive Name :  Bergstrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  24.4 grams
Max Weight :  34 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  antimicrobial regimen
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-01
Date of Upload :  2021-11-11
Persistence Vector :  1-3-6-Neuron-Final.pvec
Note :  The animal was administered with 2 mg/ml neomycin; 2 mg/ml bacitracin; 1.2 microg/ml pimaricin in tap water for 10 days

Reference Article
Related Article Reference :  Sex differences in gut microbiota modulation of aversive conditioning, open field activity, and basolateral amygdala dendritic spine density.

Measurements
Soma Surface :  805.94 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  41
Number of Branches :  93
Overall Width :  269.33 μm
Overall Height :  178.12 μm
Overall Depth :  90.76 μm
Average Diameter :  1.39 μm
Total Length :  4209.86 μm
Total Surface :  18349.7 μm2
Total Volume :  6770.29 μm3
Max Euclidean Distance :  212.29 μm
Max Path Distance :  303.6 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  7047
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.68
Average Bifurcation Angle Local :  86.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.89°
Fractal Dimension :  1.05

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