8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_167861
Cell Name :  1-3-5-Neuron
Archive Name :  Bergstrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  24.4 grams
Max Weight :  34 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  antimicrobial regimen
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-01
Date of Upload :  2021-11-11
Persistence Vector :  1-3-5-Neuron.pvec
Note :  The animal was administered with 2 mg/ml neomycin; 2 mg/ml bacitracin; 1.2 microg/ml pimaricin in tap water for 10 days

Reference Article
Related Article Reference :  Sex differences in gut microbiota modulation of aversive conditioning, open field activity, and basolateral amygdala dendritic spine density.

Measurements
Soma Surface :  755.59 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  47
Overall Width :  129.39 μm
Overall Height :  174.41 μm
Overall Depth :  37.17 μm
Average Diameter :  1.69 μm
Total Length :  1168.45 μm
Total Surface :  6474.88 μm2
Total Volume :  3135.91 μm3
Max Euclidean Distance :  152.33 μm
Max Path Distance :  169.36 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  2302
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  1.63
Average Bifurcation Angle Local :  85.39°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.29°
Fractal Dimension :  1.05

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