8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107669
Cell Name :  1-0-19-0-50
Archive Name :  Chadderton
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  inferior colliculus, Dorsal cortex
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2018-11-22
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  1-0-19-0-50.pvec
Note :  Cells were labeled by viral transfection using post-mGRASP (AAV-CAG-post-mGRASP-2A-dTomato)

Reference Article
Related Article Reference :  Combining mGRASP and Optogenetics Enables High-Resolution Functional Mapping of Descending Cortical Projections.

Measurements
Soma Surface :  828.39 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  31
Overall Width :  132.25 μm
Overall Height :  224.92 μm
Overall Depth :  40.65 μm
Average Diameter :  0.98 μm
Total Length :  922.08 μm
Total Surface :  3022.63 μm2
Total Volume :  868.12 μm3
Max Euclidean Distance :  173.04 μm
Max Path Distance :  197.26 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  681
Partition Asymmetry :  0.19
Average Rall's Ratio :  1.74
Average Bifurcation Angle Local :  95.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.1°
Fractal Dimension :  1.04

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