8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_59692
Cell Name :  09_02_04_1K
Archive Name :  Kole
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  40.0 days
Max Age :  140.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, hindlimb representation, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-12-16
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  09_02_04_1K.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Inherited cortical HCN1 channel loss amplifies dendritic calcium electrogenesis and burst firing in a rat absence epilepsy model.

Measurements
Soma Surface :  1250.93 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  63
Number of Branches :  133
Overall Width :  267.53 μm
Overall Height :  880.42 μm
Overall Depth :  134.49 μm
Average Diameter :  0.87 μm
Total Length :  10060.3 μm
Total Surface :  29041.3 μm2
Total Volume :  8623.27 μm3
Max Euclidean Distance :  751.04 μm
Max Path Distance :  1024.32 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  21749
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.69
Average Bifurcation Angle Local :  85.36°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.53°
Fractal Dimension :  1.07

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