8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_65054
Cell Name :  090826CHR2_2_rotated_without_ax_and_cont
Archive Name :  Groh
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Thick-tufted
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-08
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  090826CHR2_2_rotated_without_ax_and_cont.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Corticothalamic Spike Transfer via the L5B-POm Pathway in vivo.

Measurements
Soma Surface :  1214.03 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  85
Overall Width :  355.93 μm
Overall Height :  469.94 μm
Overall Depth :  80.67 μm
Average Diameter :  0.74 μm
Total Length :  6457.47 μm
Total Surface :  15535 μm2
Total Volume :  4104.16 μm3
Max Euclidean Distance :  504.91 μm
Max Path Distance :  553.76 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  2743
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.39
Average Bifurcation Angle Local :  77.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.14°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website