8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283451
Cell Name :  090126b_KO_MOf_layer_II_III
Archive Name :  Komulainen
Species Name :  mouse
Strain :  Jnk1-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  8.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  motor, primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  c-Jun N-terminal kinase 1 (JNK1) knockout
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  180  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-05-19
Date of Upload :  2024-07-15
Persistence Vector :  090126b_KO_MOf_layer_II_III.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  JNK1 controls dendritic field size in L2/3 and L5 of the motor cortex, constrains soma size, and influences fine motor coordination.

Measurements
Soma Surface :  532.97 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  18
Overall Width :  87.94 μm
Overall Height :  210.69 μm
Overall Depth :  23.42 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  626.29 μm
Total Surface :  491.88 μm2
Total Volume :  30.74 μm3
Max Euclidean Distance :  116.53 μm
Max Path Distance :  123.92 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  154
Partition Asymmetry :  0.29
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  69.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  35.76°
Fractal Dimension :  1.02

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