8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33242
Cell Name :  081210-A16-16to54-02up
Archive Name :  Kim
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 50% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2014-04-10
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  081210-A16-16to54-02up.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Structured synaptic connectivity between hippocampal regions.

Measurements
Soma Surface :  2129.36 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  45
Number of Branches :  94
Overall Width :  333.16 μm
Overall Height :  873.03 μm
Overall Depth :  31.18 μm
Average Diameter :  1.8 μm
Total Length :  9136.95 μm
Total Surface :  51648.7 μm2
Total Volume :  25211.9 μm3
Max Euclidean Distance :  256.72 μm
Max Path Distance :  274.72 μm
Max Branch Order :  6.79
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  3630
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.89
Average Bifurcation Angle Local :  77.22°
Average Bifurcation Angle Remote :  41.99°
Fractal Dimension :  1.01

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