8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33241
Cell Name :  081210-A16-16to54-01upNew
Archive Name :  Kim
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 50% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2014-04-10
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  081210-A16-16to54-01upNew.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Structured synaptic connectivity between hippocampal regions.

Measurements
Soma Surface :  2822.31 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  49
Number of Branches :  102
Overall Width :  336.96 μm
Overall Height :  731.42 μm
Overall Depth :  34.25 μm
Average Diameter :  1.77 μm
Total Length :  9665.24 μm
Total Surface :  54041.8 μm2
Total Volume :  26617.3 μm3
Max Euclidean Distance :  215.39 μm
Max Path Distance :  236.82 μm
Max Branch Order :  5.33
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  3856
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.85
Average Bifurcation Angle Local :  69.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.33°
Fractal Dimension :  1.01

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