8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33240
Cell Name :  081210-A15-8to56-01upPy
Archive Name :  Kim
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 50% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2014-04-10
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  081210-A15-8to56-01upPy.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Structured synaptic connectivity between hippocampal regions.

Measurements
Soma Surface :  2495.73 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  39
Number of Branches :  82
Overall Width :  481.68 μm
Overall Height :  764.7 μm
Overall Depth :  21.48 μm
Average Diameter :  1.93 μm
Total Length :  7526.16 μm
Total Surface :  46018 μm2
Total Volume :  24635.2 μm3
Max Euclidean Distance :  231.12 μm
Max Path Distance :  261.5 μm
Max Branch Order :  5.08
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  2982
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  80.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  44.17°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website