8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_170953
Cell Name :  080709a-100
Archive Name :  Bathellier_Larkum
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-12
Date of Upload :  2021-12-16
Persistence Vector :  080709a-100.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Properties of piriform cortex pyramidal cell dendrites: implications for olfactory circuit design.

Measurements
Soma Surface :  1062.92 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  57
Number of Branches :  122
Overall Width :  530.38 μm
Overall Height :  817.47 μm
Overall Depth :  67.12 μm
Average Diameter :  0.69 μm
Total Length :  9796.06 μm
Total Surface :  21884.1 μm2
Total Volume :  4954.27 μm3
Max Euclidean Distance :  782 μm
Max Path Distance :  925.86 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  10444
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.3
Average Bifurcation Angle Local :  63.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  44.34°
Fractal Dimension :  1.05

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