8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_53136
Cell Name :  071_pre
Archive Name :  Jonas
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  35 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  CA3b, pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-29
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  071_pre.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Synaptic mechanisms of pattern completion in the hippocampal CA3 network.

Measurements
Soma Surface :  829.66 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  35
Number of Branches :  72
Overall Width :  506.34 μm
Overall Height :  397.26 μm
Overall Depth :  81.41 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  5357.04 μm
Total Surface :  4916.53 μm2
Total Volume :  1090.28 μm3
Max Euclidean Distance :  488.75 μm
Max Path Distance :  681.2 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  4782
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.4
Average Bifurcation Angle Local :  77.87°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.07°
Fractal Dimension :  1.06

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