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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07312
Cell Name :  070607c7
Archive Name :  Nolan
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  29.0 days
Max Age :  58.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, layer 2
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected 80% in z
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-01-17
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  070607c7.pvec
Note :  Dorsodist=2083µm, IR=56.5186MOhm, tau=18.12ms, Dend.area=17647.4µm2

Reference Article
Related Article Reference :  Tuning of synaptic integration in the medial entorhinal cortex to the organization of grid cell firing fields

Measurements
Soma Surface :  587.76 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  47
Number of Branches :  103
Overall Width :  862.23 μm
Overall Height :  672.04 μm
Overall Depth :  145.49 μm
Average Diameter :  0.89 μm
Total Length :  9193.94 μm
Total Surface :  25776.9 μm2
Total Volume :  6031.23 μm3
Max Euclidean Distance :  827.8 μm
Max Path Distance :  943.72 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  3157
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.6
Average Bifurcation Angle Local :  70.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  62°
Fractal Dimension :  1.06

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