8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_189658
Cell Name :  060117A_KO
Archive Name :  Brager
Species Name :  mouse
Strain :  fmr1 KO C57/B6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Fmr1 knockout
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2022-05-16
Date of Upload :  2022-06-10
Persistence Vector :  060117A_KO.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered A-type potassium channel function impairs dendritic spike initiation and temporoammonic long-term potentiation in Fragile X syndrome.

Measurements
Soma Surface :  1078.53 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  60
Overall Width :  143.01 μm
Overall Height :  335.3 μm
Overall Depth :  87.02 μm
Average Diameter :  0.84 μm
Total Length :  2999.6 μm
Total Surface :  7821.68 μm2
Total Volume :  1745.98 μm3
Max Euclidean Distance :  366.99 μm
Max Path Distance :  463.57 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  3544
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.72
Average Bifurcation Angle Local :  70.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.59°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website