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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33228
Cell Name :  0515-12Lpy
Archive Name :  Kim
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 50% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2014-04-10
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  0515-12Lpy.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Structured synaptic connectivity between hippocampal regions.

Measurements
Soma Surface :  2986.56 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  61
Number of Branches :  126
Overall Width :  522.49 μm
Overall Height :  1047.81 μm
Overall Depth :  16.64 μm
Average Diameter :  1.85 μm
Total Length :  11464 μm
Total Surface :  66150.2 μm2
Total Volume :  34876.3 μm3
Max Euclidean Distance :  304.07 μm
Max Path Distance :  340.37 μm
Max Branch Order :  9.5
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  4450
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  1.66
Average Bifurcation Angle Local :  78.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.42°
Fractal Dimension :  1.01

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