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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_09492
Cell Name :  050217-zB
Archive Name :  Krieger
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/CLM-11
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-09-25
Date of Upload :  2013-05-06
Persistence Vector :  050217-zB.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Synaptic connections between layer 5B pyramidal neurons in mouse somatosensory cortex are independent of apical dendrite bundling.

Measurements
Soma Surface :  729.91 μm2
Number of Stems :  13
Number of Bifurcations :  47
Number of Branches :  107
Overall Width :  286.91 μm
Overall Height :  1000.01 μm
Overall Depth :  52.28 μm
Average Diameter :  0.8 μm
Total Length :  9067.51 μm
Total Surface :  27270.5 μm2
Total Volume :  8603.4 μm3
Max Euclidean Distance :  769.43 μm
Max Path Distance :  955.76 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  13564
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.5
Average Bifurcation Angle Local :  86.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.02°
Fractal Dimension :  1.04

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