8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_127013
Cell Name :  0334_00654_1L_C03_01
Archive Name :  Farrow
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  colliculo-parabigeminal circuit projecting, CART-positive
Original Format :  TREES toolbox.mat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  TREES toolbox
Date of Deposition :  2019-12-09
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  0334_00654_1L_C03_01.pvec
Note :  Virus injected in 3-5 weeks old animals

Reference Article
Related Article Reference :  A projection specific logic to sampling visual inputs in mouse superior colliculus.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  291
Number of Branches :  584
Overall Width :  274.42 μm
Overall Height :  380.51 μm
Overall Depth :  94.56 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  9901.52 μm
Total Surface :  31106.5 μm2
Total Volume :  7776.63 μm3
Max Euclidean Distance :  266.99 μm
Max Path Distance :  381.65 μm
Max Branch Order :  26
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1129
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  87.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.45°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website