8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_98569
Cell Name :  03-21-14-Slice-2
Archive Name :  Danzer
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.2 months
Max Age :  8.2 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  PTEN Knockout
Staining Method :  Streptavidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-25
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  03-21-14-Slice-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  PTEN deletion increases hippocampal granule cell excitability in male and female mice.

Measurements
Soma Surface :  798.26 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  51
Overall Width :  103.14 μm
Overall Height :  273.95 μm
Overall Depth :  110 μm
Average Diameter :  0.16 μm
Total Length :  3120.71 μm
Total Surface :  1568.64 μm2
Total Volume :  62.75 μm3
Max Euclidean Distance :  246 μm
Max Path Distance :  272.78 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  834
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  50.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  30.52°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website