8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33214
Cell Name :  020910-04-3to31-01upPy
Archive Name :  Kim
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 50% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2014-04-10
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  020910-04-3to31-01upPy.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Structured synaptic connectivity between hippocampal regions.

Measurements
Soma Surface :  2702.88 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  43
Number of Branches :  90
Overall Width :  417.94 μm
Overall Height :  813.38 μm
Overall Depth :  24.02 μm
Average Diameter :  2.04 μm
Total Length :  9602 μm
Total Surface :  62076.1 μm2
Total Volume :  34701.69 μm3
Max Euclidean Distance :  240.93 μm
Max Path Distance :  267.43 μm
Max Branch Order :  5.5
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  3712
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  66.81°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.57°
Fractal Dimension :  1.01

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