8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108838
Cell Name :  012117B_ECA
Archive Name :  Arnold_Johnston
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  350 grams
Max Weight :  350 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer, dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-05-01
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  012117B_ECA.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Epilepsy-Induced Reduction in HCN Channel Expression Contributes to an Increased Excitability in Dorsal, But Not Ventral, Hippocampal CA1 Neurons.

Measurements
Soma Surface :  861.74 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  76
Number of Branches :  156
Overall Width :  234.08 μm
Overall Height :  728.98 μm
Overall Depth :  164.97 μm
Average Diameter :  0.73 μm
Total Length :  10289.3 μm
Total Surface :  22442 μm2
Total Volume :  4883.76 μm3
Max Euclidean Distance :  655.69 μm
Max Path Distance :  837.18 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  15543
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.61
Average Bifurcation Angle Local :  89.32°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.72°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website