8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145778
Cell Name :  011-4wk-WT-IBA1-CD68-CALB-63X-1002a
Archive Name :  Kavetsky
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J-Npc1nmf164/J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  vermis
Tertiary Brain Region :  anterior, lobule I-IV
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive, CD68-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-10-12
Date of Upload :  2020-12-09
Persistence Vector :  011-4wk-WT-IBA1-CD68-CALB-63X-1002a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Increased interactions and engulfment of dendrites by microglia precede Purkinje cell degeneration in a mouse model of Niemann Pick Type-C.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  35
Overall Width :  20.27 μm
Overall Height :  35.42 μm
Overall Depth :  75.47 μm
Average Diameter :  0.75 μm
Total Length :  384.15 μm
Total Surface :  926.52 μm2
Total Volume :  187.41 μm3
Max Euclidean Distance :  60.92 μm
Max Path Distance :  97.65 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1424
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2.11
Average Bifurcation Angle Local :  32.57°
Average Bifurcation Angle Remote :  96.96°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website