8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_111991
Cell Name :  01082016c1
Archive Name :  Topolnik
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai32
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  15 grams
Max Weight :  20 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  oriens/alveus border
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-04-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  01082016c1.pvec
Note :  Soma surface should be used for quantitative analysis

Reference Article
Related Article Reference :  Connectivity and network state-dependent recruitment of long-range VIP-GABAergic neurons in the mouse hippocampus.

Measurements
Soma Surface :  852.07 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  117
Number of Branches :  239
Overall Width :  1025.46 μm
Overall Height :  681.45 μm
Overall Depth :  52.44 μm
Average Diameter :  1.05 μm
Total Length :  11939 μm
Total Surface :  37928.9 μm2
Total Volume :  10819 μm3
Max Euclidean Distance :  925.33 μm
Max Path Distance :  1196.86 μm
Max Branch Order :  31
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  2744
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  78.87°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.18°
Fractal Dimension :  1.03

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