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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145757
Cell Name :  010-4wk-NPC1-IBA1-CD68-CALB-63X-1006a
Archive Name :  Kavetsky
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J-Npc1nmf164/J;Npc1nmf16
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  vermis
Tertiary Brain Region :  anterior, lobule I-IV
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive, CD68-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  NPC1 mutant
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-10-12
Date of Upload :  2020-12-09
Persistence Vector :  010-4wk-NPC1-IBA1-CD68-CALB-63X-1006a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Increased interactions and engulfment of dendrites by microglia precede Purkinje cell degeneration in a mouse model of Niemann Pick Type-C.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  33
Overall Width :  14.98 μm
Overall Height :  63.59 μm
Overall Depth :  51.42 μm
Average Diameter :  0.77 μm
Total Length :  337.8 μm
Total Surface :  842.52 μm2
Total Volume :  177.39 μm3
Max Euclidean Distance :  42.8 μm
Max Path Distance :  60.33 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  1334
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2.07
Average Bifurcation Angle Local :  36.08°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.16°
Fractal Dimension :  1.05

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