8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145773
Cell Name :  009-4wk-NPC-IBA1-CD68-CALB-63X-2a
Archive Name :  Kavetsky
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J-Npc1nmf164/J;Npc1nmf16
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  vermis
Tertiary Brain Region :  anterior, lobule I-IV
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive, CD68-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  NPC1 mutant
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-10-12
Date of Upload :  2020-12-09
Persistence Vector :  009-4wk-NPC-IBA1-CD68-CALB-63X-2a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Increased interactions and engulfment of dendrites by microglia precede Purkinje cell degeneration in a mouse model of Niemann Pick Type-C.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  22
Overall Width :  13.4 μm
Overall Height :  50.76 μm
Overall Depth :  35.8 μm
Average Diameter :  1.14 μm
Total Length :  203.53 μm
Total Surface :  749.13 μm2
Total Volume :  251.56 μm3
Max Euclidean Distance :  41.87 μm
Max Path Distance :  55.93 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  827
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  2.05
Average Bifurcation Angle Local :  40.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.61°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website