8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83238
Cell Name :  0005_5
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Early training
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  0005_5.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  128.36 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  90
Number of Branches :  183
Overall Width :  203.04 μm
Overall Height :  653.73 μm
Overall Depth :  138.43 μm
Average Diameter :  1.7 μm
Total Length :  11143.6 μm
Total Surface :  59079.5 μm2
Total Volume :  28637.2 μm3
Max Euclidean Distance :  601.94 μm
Max Path Distance :  715.82 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  3404
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.34
Average Bifurcation Angle Local :  70.03°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.03°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website