8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83132
Cell Name :  0005-2_2
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Anterior thalamic nuclei lesion
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  0005-2_2.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  65.44 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  53
Overall Width :  172.37 μm
Overall Height :  129.89 μm
Overall Depth :  128.61 μm
Average Diameter :  1.45 μm
Total Length :  3063.13 μm
Total Surface :  13886.8 μm2
Total Volume :  5088.21 μm3
Max Euclidean Distance :  178.74 μm
Max Path Distance :  202.31 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  952
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.61
Average Bifurcation Angle Local :  67.47°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.85°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website