8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83080
Cell Name :  0003-4_1
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Anterior thalamic nuclei lesion
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  0003-4_1.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  148.14 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  83
Number of Branches :  172
Overall Width :  352.57 μm
Overall Height :  441.19 μm
Overall Depth :  134.65 μm
Average Diameter :  1.54 μm
Total Length :  9465.23 μm
Total Surface :  45817.7 μm2
Total Volume :  19484.7 μm3
Max Euclidean Distance :  417.67 μm
Max Path Distance :  658.89 μm
Max Branch Order :  27
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  3286
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.52
Average Bifurcation Angle Local :  63.12°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.32°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website