8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83042
Cell Name :  0003-4
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Anterior thalamic nuclei lesion
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  0003-4.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  48.92 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  69
Number of Branches :  143
Overall Width :  247.77 μm
Overall Height :  660.14 μm
Overall Depth :  134.94 μm
Average Diameter :  1.61 μm
Total Length :  7792.43 μm
Total Surface :  39449.7 μm2
Total Volume :  18107.5 μm3
Max Euclidean Distance :  590.23 μm
Max Path Distance :  732.68 μm
Max Branch Order :  34
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  2336
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  67.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.78°
Fractal Dimension :  1.02

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