8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83079
Cell Name :  0003-3_1
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Anterior thalamic nuclei lesion
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  0003-3_1.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  53.51 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  77
Number of Branches :  158
Overall Width :  229.25 μm
Overall Height :  575.32 μm
Overall Depth :  134.8 μm
Average Diameter :  1.49 μm
Total Length :  8904.55 μm
Total Surface :  40884.5 μm2
Total Volume :  16567.2 μm3
Max Euclidean Distance :  514 μm
Max Path Distance :  615.4 μm
Max Branch Order :  28
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  2516
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.53
Average Bifurcation Angle Local :  68.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.87°
Fractal Dimension :  1.03

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