8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83227
Cell Name :  0002_5
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Early training
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  0002_5.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  95.28 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  65
Number of Branches :  132
Overall Width :  294.35 μm
Overall Height :  558.19 μm
Overall Depth :  136.65 μm
Average Diameter :  1.59 μm
Total Length :  8137.17 μm
Total Surface :  40266.5 μm2
Total Volume :  18333.4 μm3
Max Euclidean Distance :  524.2 μm
Max Path Distance :  637.62 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  3317
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.48
Average Bifurcation Angle Local :  73.52°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.25°
Fractal Dimension :  1.03

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