8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83217
Cell Name :  0001-3_5
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Early training
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  0001-3_5.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  63.41 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  92
Number of Branches :  189
Overall Width :  223.89 μm
Overall Height :  415.51 μm
Overall Depth :  165.28 μm
Average Diameter :  1.59 μm
Total Length :  10606.9 μm
Total Surface :  52177.9 μm2
Total Volume :  22482.5 μm3
Max Euclidean Distance :  339.89 μm
Max Path Distance :  463.07 μm
Max Branch Order :  24
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  3406
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.42
Average Bifurcation Angle Local :  66.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.41°
Fractal Dimension :  1.02

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